U šišáku bajkalského se užívá kořen,někteří podvodníci prodávají nadzemní část, ta však léčivá není. Kořen se sklízí mimo hlavní vegetační období tedy na jaře nebo na podzim. Při sklizni používáme rostliny 2 leté, odřežeme část kořenů, zbytek rostliny ošetříme v místě odřezání kořenu buď jílem nebo…